Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms