Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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