Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms