Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms