Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms