Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms