Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms