Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms