Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms