Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeleQ00690 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms