Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atp9bP98195 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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