Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tarbp2P97473 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tarbp2P97473 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tarbp2P97473 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tarbp2P97473 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tarbp2P97473 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tarbp2P97473 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.2 ms