Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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