Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms