Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms