Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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