Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nup43P59235 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nup43P59235 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nup43P59235 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms