Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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