Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CartptP56388 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CartptP56388 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms