Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CtskP55097 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CtskP55097 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CtskP55097 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CtskP55097 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtskP55097 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtskP55097 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms