Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FmodP50608 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FmodP50608 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms