Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms