Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TgfaP48030 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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