Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gli1P47806 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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