Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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