Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col18a1P39061 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms