Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsx2P31316 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms