Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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