Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxraP28700 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxraP28700 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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