Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PparaP23204 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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PparaP23204 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PparaP23204 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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