Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3aP23116 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms