Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RarbP22605 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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