Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms