Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18533 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18533 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
P18533 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18533 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18533 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms