Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gata1P17679 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gata1P17679 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gata1P17679 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms