Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf1P15314 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf1P15314 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf1P15314 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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