Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DmdP11531 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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