Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms