Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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