Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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