Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P04212 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P04212 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P04212 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P04212 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P04212 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P04212 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P04212 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms