Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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