Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops6O88545 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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