Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfdp1O88271 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cfdp1O88271 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfdp1O88271 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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