Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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