Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms