Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ptpn20O55082 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ptpn20O55082 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ptpn20O55082 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ptpn20O55082 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ptpn20O55082 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms