Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms