Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TsksO54887 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TsksO54887 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TsksO54887 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms