Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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